1996年
4月13～14日，医院第一次职工代表暨工会会员代表大会隆重召开。
6月3日，神经内科建筑面积500平方米、价值634084.77元的试验楼正式投入使用。
6月6日，是全国第一个“爱眼日”，河北省眼病防治研究中心在医院成立。
6月6日，医院为核医学科引进法国SOPHY公司DST SPECT（双矩形探测器单光子发射型计算机断层仪，简称ECT）举行了开机典礼。
7月5日，河北医科大学临床医学博士学位培养点在河北医科大学第二医院消化内科建立。
9月2日，经河北省教育委员会、河北省卫生厅批准,医院隆重举行 “柯棣华中印友好医院”挂牌揭幕暨柯棣华医疗队专家义诊仪式。
12月28日，设病床1016张，建筑面积为4万平方米的医院病房新大楼竣工并投入使用。
本年度，医院神经内科“格林-巴利”课题组荣获国家科技进步二等奖。
1997年
7月9日，河北省首例经口入路环枢椎脱位齿状突切除及前固定术在医院神经外科获得成功。
9月10日，河北省科学技术委员会批准成立“河北省消化病研究所”，该所设在河北医科大学第二医院（隶属河北医科大学第二医院领导）。
12月12～13日，河北医科大学第二医院召开了第一届职工代表大会第二次会议。
1998年
4月17日，河北省卫生厅批准成立“河北省生殖医学中心”，该中心设在河北医科大学第二医院（隶属河北医科大学第二医院领导）。
5月22日上午8时45分，河北省首例试管婴儿在河北医科大学第二医院顺利降生，婴儿为男性，体重3900g，身高50厘米，身体健康，这标志着河北省生殖医学研究已步入全国先进行列。
6月9日，河北省科学技术委员会批准成立“河北省血液病研究所”。该所设在河北医科大学第二医院（隶属河北医科大学第二医院领导）。
9月16日，河北省中医管理局批准成立“河北省中西医结合抗衰老防治研究中心”及“河北省中西医结合疡科病研究室”,均设在河北医科大学第二医院（隶属河北医科大学第二医院领导）。
9月22日，医院为纪念印度医疗队来华60周年，举办了柯棣华塑像揭幕仪式。
12月10日，河北省卫生厅批准成立“河北省肝胆病治疗研究中心”，该中心设在河北医科大学第二医院（隶属河北医科大学第二医院领导）。
本年度，李春岩获“省长特别奖”。
1999年
3月6日，医院第一届职工代表大会第三次会议隆重开幕。
12月21日下午3时15分，河北省首例5胞胎婴儿在医院手术室降生。
12月30日，国家药品监督管理局为河北医科大学第二医院颁发“国家药品临床研究基地”证书。
2000年
1月25日，医院造血干细胞移植术成功。
2月16日，医院心脏外科主任刘苏成功实施一例左室室壁瘤切除术与冠脉搭桥手术，标志着医院心脏外科技术达到国内先进水平。
3月2日，九届全国人大代表，河北医科大学第二医院博士生导师、全国著名消化病专家姚希贤教授参加九届全国人大三次会议。
2001年
2月21日，医院神经内科学专业成为首批河北省“燕赵学者特聘岗位”。李春岩教授获得“燕赵学者”称号。
7月25日，河北省医学影像及功能检查专业管理委员会成立。学会会址设于河北医科大学第二医院。
8月16日，在河北省卫生厅隆重召开的“全省卫生科教大会”上，医院血液内科、神经内科、消化内科、妇产科、眼科、泌尿外科6个学科荣获省级重点学科，心血管内科获重点发展学科，医院荣获的重点学科占全省卫生系统重点学科的1/3强，位居全省首位。
11月20日，医院泌尿外科专家、博士研究生导师、院长蔡文清教授亲自主刀进行了医院首例亲属活体肾移植手术获得成功。
12月12日，中国工程院新闻发布会公布河北医科大学第二医院神经内科博士研究生导师李春岩教授，当选中国工程院院士。
2002年
2月20日9点30分，医院“第二代试管婴儿”首例胎儿顺利降生。
2月22日，河北省中医药管理局批准在河北医科大学第二医院建立“河北省中西医结合神经病学研究室”。
3月1日，中国2001国际志愿者年委员会授予河北医科大学第二医院“中国优秀志愿服务集体”称号。
4月25日，心脏外科成功实施省内首例主动脉瓣置换和冠脉搭桥手术。
6月11日，医院血液内科成功实施了河北省首例自体外周血干细胞移植术。
8月6～7日，中共河北医科大学第二医院第一次代表大会召开。
8月，医院荣获中国医院协会“医疗优质高效 百姓放心医院”荣誉称号。
9月8日，在中华医院管理学会优秀院长表彰会上，院长、博士研究生导师蔡文清教授荣获“2002年度全国优秀院长”荣誉称号。
11月8日，院长蔡文清作为代表赴北京参加中国共产党第十六次全国代表大会。
12月7日，微创外科成功地为一位78岁男性胃癌患者实施了电视腹腔镜胃大部切除术，此手术为河北省首例。
12月10日，医院口腔外科为一位1岁6个月的女孩成功地实施了罕见的复杂面裂畸形（先天性下唇、下颌正中裂伴右侧舌、软腭、眼畸形及舌异位甲状腺患者）手术。
2003年
3月3日，肝胆外科历经13个小时的手术，将一位28岁母亲肝脏的3/5顺利地移植到7岁女儿贾素云的身上，该项移植技术为河北省首例活体肝脏移植术。
3月7～8日，河北医科大学第二医院第二届职工代表大会举行。
4月28日，心脏外科专家经5个小时为一位32岁男性患者成功实施了河北省首例同种异体原位心脏移植手术。
5月18日，河北省首例冻融胚胎试管婴儿——体重3000克的健康男婴在河北医科大学第二医院生殖医学中心顺利诞生。
5月，河北省人民政府授予马俊义、王保法“2003年河北省防治非典型肺炎优秀医务工作者”荣誉称号。
6月2日，医院第一台立式X线摄影架正式在医院发热门诊启用。
6月27日，中共河北省委决定授予河北医科大学第二医院党委“河北省抗击非典斗争先进基层党组织”荣誉称号，中共河北省委、河北省政府授予河北医科大学第二医院“河北省抗击非典斗争先进集体”荣誉称号。
6月28日，经中共中央同意，中组部决定授予河北医科大学第二医院党委“全国防治非典型肺炎工作先进基层党组织”荣誉称号。
6月30日，河北省教育工委、省教育厅党组授予河北医科大学第二医院党委“先进基层党组织”称号。省会防治非典联合指挥部授予马俊义“省会防治非典工作优秀专家”荣誉称号；河北省委、河北省教育工委授予王保法“优秀共产党员” 荣誉称号。
6月，河北省委授予王保法“河北省抗击非典斗争优秀共产党员” 荣誉称号。河北省委、河北省人民政府授予王保法“河北省抗击非典斗争先进个人” 荣誉称号。
7月8日，心脏外科成功为一名32岁急症垂危女性患者实施了胸降主动脉瘤人工血管置换术，填补了省内该项技术空白。
8月，史利克被中华医院管理学会医院感染专业委员会等4个单位联合评为全国医院感染管理系统抗击“非典”先进个人。
9月22日，中国中西医结合学会授予马俊义“全国中西医结合防治SARS优秀科技工作者”荣誉称号。
10月27～28日，历经十几个小时，医院骨科成功实施了建院以来的首例断腕（左腕）再植术。
12月25日，河北医科大学第二医院被河北省卫生厅评为“河北省授外医疗工作先进单位”，小儿科主任李根山教授，肾内科王彦教授被评为先进个人。
在团省委、省青联、省人事厅等20家单位联合开展的2003年度“河北省十大杰出青年”评选活动中，医院心内科副主任，主任医师、博士研究生导师崔炜教授荣获“河北十大杰出青年”光荣称号。
河北医科大学第二医院被石家庄市卫生局、石家庄市卫生防疫站评为“石家庄市医院感染管理先进单位”荣誉称号。
2004年
3月6日，在省妇联、省科技厅、省知识产权局、石家庄市妇联联合举办的迎“三·八”河北省十大科技女杰评比活动中，河北医科大学第二医院副院长赵玲教授获“省十大科技女杰”和“三·八红旗手”光荣称号。
4月30日，在河北省劳模表彰大会上，河北医科大学第二医院干部病房主任、博士研究生导师傅向华教授被省政府授予“河北省特级劳动模范”荣誉称号。
4月30日，在石家庄市劳模表彰大会上，河北医科大学第二医院肾内科主任傅淑霞教授被石家庄市委、市政府授予“石家庄市职工劳动模范”荣誉称号。
7月7日，河北医科大学第二医院被中国医院协会评为首批“全国百姓放心示范医院”。副院长刘怀军获得“全国百姓放心示范医院优秀管理者”荣誉称号。
9月3日，河北省首例宫颈癌腹腔镜切除术在河北医科大学第二医院成功实施。
9月4～5日，河北省首届妇产科腔镜研讨会暨省医学会妇产科腔镜学组成立大会在河北医科大学第二医院召开。
9月15日，河北省首例异体亲缘造血干细胞移植治疗重型“再障”技术在河北医科大学第二医院获得成功。
9月异体同基因（同卵双生）外周血干细胞移植在河北医科大学第二医院成功实施。
10月14～16日，民进中央在北京召开《民进全国基层组织建设工作暨先进基层组织》表彰大会，河北医科大学第二医院民进支部继1995年获得全国先进基层支部后，再次获得这一荣誉称号。
10月20日，河北医科大学第二医院医学影像科成功实施河北省首例颅内动脉狭窄支架成形术。
11月26日，河北省首例非亲缘性异体基因造血干细胞移植在在河北医科大学第二医院成功实施。
2005年
3月25日，我院第二届职工代表大会第三次会议，在图书馆多功能报告厅隆重召开。
5月12日，我院一日病房被国家卫生部、中华全国妇联、总后卫生部联合授予全国“巾帼文明岗”荣誉称号。